Les objectifs principaux du Centre de ressources du patrimoine naturel et des zones humides du bassin de la Loire sont les suivants :

• Contribuer à l'amélioration des connaissances sur les thèmes relatifs au patrimoine naturel ligérien et au fonctionnement de l'hydrosystème ;
• Faciliter l'accessibilité et le transfert d'informations depuis les sources de données existantes vers les différents utilisateurs ;
• Permettre une aide à la décision par la mise à disposition d'outils et/ou par la contribution à la mise en œuvre des politiques publiques ;
• Contribuer à identifier les besoins de recherche en rapport avec le patrimoine naturel et les zones humides;
• Permettre la mutualisation des connaissances et faciliter le lien avec les principales thématiques de la Plate-forme "Eau Espaces Espèces".

Afin de mutualiser l'information, de favoriser les échanges entre acteurs et au final d'aider à la prise de décision, le Centre de ressources met à disposition un certain nombre d'outils par le biais de son site internet :

• L'identification des sources de données naturalistes sur le bassin ;
• Un recueil d'expériences de gestion par types de milieux ;
• Une base documentaire plus de 2 000 références bibliographiques (ouvrages, rapport d'études, d'inventaire ou d'activité...) sont consultables en ligne ou disponibles dans les locaux de la FCEN ;
• Des protocoles et méthodes harmonisées. Mis à disposition du plus grand nombre, ils favorisent le recueil de données harmonisées, et facilitent l'analyse et la consolidation des données.