Le Centre de Ressources s’intéresse au patrimoine naturel et aux zones humides afin de répondre aux besoins des acteurs et usagers du bassin de la Loire. Plusieurs thématiques font l’objet d’une attention particulière comme le réseau Natura 2000, les zones humides et les plantes exotiques envahissantes. D’autres thématiques sont également traitées dans le cadre du centre de ressources sans être mise en avant sur le site web : la dynamique fluviale, les corridors écologiques ou bien encore les têtes de bassin versants.